I Centri sono strutture formate da due o più Dipartimenti e/o dall'Amministrazione. La loro funzione è di potenziare le attività di ricerca e/o i servizi integrando i settori disciplinari e migliorando l'uso delle risorse. Lo Statuto della Sapienza prevede la possibilità di istituire Centri di ricerca, Centri di ricerca e servizi e Centri di servizi in numero non superiore al 50% di quello dei Dipartimenti. I Centri si dotano di regolamenti propri, elaborati sulla base di regolamenti tipo.

La Sapienza partecipa inoltre a Centri interuniversitari insieme ad altri atenei.